Alex : Le traumatisme
Alex et Joshua semblaient être deux frères qui tenaient autant l’un qu’à l’autre. En effet, ils faisaient de nombreux jeux ensembles (comme en témoigne, par exemple, la cassette écoutable dans la maison, la première fois).
Cela dit, Adam, leur père, séparait souvent Josh d’Alex. Sachant déjà qu’Adam allait choisir Alex pour accomplir le rituel, il cherchait sûrement à séparer Josh pour qu’il ne s’attache pas à celui-ci. Ce qui explique l’amour que le père apporte à Josh et qu’il refuse à Alex.
Finalement, un soir, Alex emmène Josh sur le lac « Toluca » pour discuter. C’est alors que la dispute se produit à propos d’un médaillon qu’Adam aurait donné à Josh.
Alex qui tente de subtiliser le collier des mains de Josh, celui-ci tente de l’en empêcher. Ceci causera ainsi la mort accidentelle du petit frère, qui se retrouve les cervicales brisées sur le rebord de la barque avant de tomber à l’eau.
Alex avertit son père et Adam finit par retrouver le corps de Josh, criant à Alex : « Cela devait être toi, pas lui ! »

Culpabilité
Alex n’a donc pas accepté la mort de son frère qu’il a lui-même causé. A partir de cet instant, celui-ci pense qu’il peut encore sauver son frère, qu’il n’était pas mort et qu’il avait besoin de lui. Il va donc se créer un rempart dans sa tête contre sa propre culpabilité.
Son père l’envoie donc dans un hôpital psychiatrique, l’hôpital Alchemilla. A l’origine cet hôpital est un centre médical et celui-ci même où Alessa fut enfermée dans les plus profonds sous-sols. Dans Homecoming, il devient un asile psychiatrique où Alex sera enfermé dans la chambre 206. (ndw : l'hôpital psychiatrique de Silent Hill est normalement Brookhaven, il faut se dire que c'est une erreur de la part de Double Helix d'avoir choisi Alchemilla).
C’est alors que le jeu commence et qu’Alex se libère, ou plutôt croit être enfin libre. En effet, Alex se crée un rêve où il s’évade pour pouvoir sauver son frère Josh. Il va alors se frayer un chemin jusqu'à Shepherd’s Glen, sa ville natale. En chemin, il croise la mère de sa meilleure amie d’enfance, Margaret Holloway, la mère d’Elle Holloway qu’il croisera aussi par la suite.
Il va alors se rendre compte d’une chose : toutes les horloges de la ville sont arrêtées sur 2:06. Si nous regardons bien, la chambre d’Alex à l’asile était la « 206 ». Ce qui veut dire que du moment où Alex fut enfermé dans cette chambre, le temps semble être arrêté.
Et en allant plus loin : on se souvient qu’Alex a emmené Joshua sur le lac de Toluca, un soir. On peut très bien en déduire que Josh est mort à 2heures 6 du matin et ainsi donc, le moment où Alex n’accepte pas la mort de son frère, le temps s’arrête pour lui.
Il est ainsi piégé dans un monde cauchemardesque, directement tiré de sa propre imagination où il n’accepte pas sa culpabilité et sa faute dans la mort de son frère.

Fantasme
Pensant donc pouvoir le sauver, étant sûr que Josh ait besoin de son frère, il va donc croire qu’il s’échappe de son asile. Encore plus loin que ça, pour se faire croire de sa force, il va aller jusqu’à croire qu’il est un militaire, comme son père. Il se bat ainsi donc comme un militaire (voir technique du couteau).
On peut trouver des indices de son fantasme militaire. Lors de la visite dans la maison altérée, on trouve dans le grenier un mannequin où est présentée la même veste militaire qu’Alex et qui devait sûrement appartenir à son père. De plus, lors de la rencontre de son père juste avant qu’il se fasse couper en deux par Bogeyman, il dit à Alex : « Alors comme ça tu portes encore mes plaques » Alex lui répond : « Qu’est ce que tu racontes, ce sont les miennes ». (ndw : sur les plaques est inscrit le nom "A. Shepherd", et le A pourrait signifier à la fois Alex ou Adam). Cela prouve encore qu’Alex est persuadé de son entraînement en camps militaire.
Toute la séquence du début, où le médecin l’emmène dans sa chambre est donc réel mais cela change à partir du moment où Bogeyman (ou Pyramid Head pour le second opus) intervient. La présence de ce monstre, peut expliquer que ce qu’Alex vit n’est qu’illusion.
Si on se souvient dans le second opus, Pyramid Head était là pour montrer à James Sunderland que certains de ses fantasmes créés dans le jeu n’était que pure imagination.

La fin choisie
Si on suit donc cette théorie, la fin appropriée serait donc la fin « Hospital », où Alex se réveille à l’asile, revenant de son cauchemar perpétuel. Et c’est ainsi qu’on voit le numéro de sa cellule « 206 », renvoyant donc aux horloges.
On y voit qu’Alex n’accepte toujours pas la mort de son frère et continue de croire qu’il doit le sauver. Voyant que le traitement ne marche pas, le médecin lui envoie donc une seconde décharge d’électro-choque.
On peut aussi noter la présence du Shérif Wheeler, ici pour surveiller le meurtrier de Josh. Cette fin colle donc avec l’explication.

Ndw : Il est intéressant de noter un détail dans le jeu. Beaucoup des énigmes utilisent l'électricité : des fils électriques à trifouiller, un générateur électrique à éteindre, et des bruits électriques incessants qui parcourent le jeu... On peut penser donc qu'Alex essaye en quelque sorte de contrôler dans son cerveau l'électricité du traitement qui le torture. (merci à thethinwhiteduke2 pour l'information).

Les monstres : Symboles
Comme dans tout Silent hill, le bestiaire est en rapport avec les sentiments, les peurs et les traumatismes des héros du jeu ou bien de certains personnages clés.
Ainsi donc, on peut expliquer la raison pour laquelle certains monstres (Needler et Amnion), par exemple, ressemblent à des araignées. Josh adorait les insectes et particulièrement les araignées et c’est d’ailleurs ce que l’on peut remarquer dans la chambre des deux frères dans la maison. On peut ainsi en déduire qu’Alex se souvient que son frère adorait ça et se transforme en une chimère, à travers les monstres qu’il croise.
On remarque aussi la présence de nombreux monstres aux formes sexuelles et prononcées comme Scarlet, Asphyxia, Amnion, Siam... Tous ces monstres peuvent peut-être faire naître un doute sur le mental d’Alex qui pourrait montrer qu’il est un pervers sexuel. En outre, on sait qu’il a toujours été attiré par Elle Holloway, le fait qu’il l’a rencontre de nouveau peut être signe d’un fantasme et d’une envie de la retrouver.
Ceci sont les monstres qui ont vraiment l’air d’avoir un sens, pour ce qui est des autres, il semblerait que cela soit moins plausible.

Explication par Cyril